農博士-以知識、技術、管理推動我國農業科技進步
誕生于2004年,做貼合中國育種實際需要的育種數據采集管理分析系統。

-=農博士育種家軟件介紹=-

新增 BLUP AB群育種分析功能
 

博思公司的農博士育種家軟件(NBSbreeding)一直在開發完善更實用更有價值的軟件功能,服務眾多軟件用戶。繼自主成功開發BLUP育種值(breeding value)線性混合模型分析方法后,前段時間又進一步推出了REML方差組分估計功能,剛剛過去的70周年國慶,博思公司技術人員一直在工作崗位加班加點,不負眾望,( BLUP  AB 育種)(GCA)功能開發成功。NBSbreeding不斷完善自身功能,我們寫文章建議植物育種領域要重視育種值應用,用育種值提升一般配合力分析水平,是考慮,植物育種在數據分析領域需要向動物育種借鑒成熟的數學分析方法。作為一款專業的植物育種軟件,我們也會把BLUP跟一般配合力(GCA)結合的線性混合模型分析技術開發出來給軟件用戶使用。我們會推薦建議,但我們一定提供給用戶多樣選擇。我們就是為育種用戶服務的。配合力的計算如果按照配合力公式,真是小學生都可以完成的計算,過于簡單了。所以一直猜測,國際種業大公司不會這樣簡單的使用配合力,這不,一種復雜的BLUP 配合力分析模型就來了。
   y =μ+ Xβ+ Ua + Wb + Zs + e

μ:試驗數據均值
β
:年度+地點的合并固定效應
a
A群一般配合力向量
b
B群一般配合力向量
s
:測配組合A×B特殊配合力向量
e
:剩余誤差向量
X
、U、W、Z
為相應關聯矩陣。

我們根據植物育種特點,參考Rex Bernardo教授及王健康老師介紹的模型,結合植物育種數據特點,提出了上述數學模型,更適合AB群模式育種使用。(2019.10.06)


新增 REML
分析 功能

REML(Restricted Maximum Likelihood)限制性最大似然估計英文首字母的縮寫,也有稱約束最大似然法,其主要功能是線性混合模型中的方差組分估計。
BLUP計算需要知道分析性狀的加性遺傳方差,因此在進行BLUP分析前,需要先用REML進行方差組分估計,或者采用經驗值。REML是比BLUP更加復雜的計算過程。主要有兩種計算方式,求導方式和非求導方式(如:DFREML算法)。NBSbreeding兩種方式都提供支持。 (2019.9)

 

BLUP育種值分析服務

自北京中農博思科技發展有限公司在國內倡導,植物育種選擇使用育種值(breeding value)以來,引起了眾多育種單位育種工作者的積極關注,農博士育種家軟件持續升級,增強對BLUP育種值計算的支持,為了方便育種單位使用BLUP育種值分析方法,博思公司正式推出面向植物育種的數據分析服務。

用戶提供數據文件和系譜文件,博思公司專業技術服務人員,就可以為用戶進行BLUP育種值數據分析服務。2019.8.2 詳情

玉米系譜研究分析及SS-NSS分析算法

     72年跨度玉米系譜研究成果及系譜研究思路方法揭秘,農博士主動公布藍玉米軟件功能實現技術路徑,為推動國內系譜大數據利用,為玉米育種技術進步,盡綿薄之力。《藍玉米育種材料分析軟件使用手冊》PDF

分子育種GBLUP育種值分析

    博思公司倡導植物育種中采用育種值用于育種選擇,并依據常規育種系譜,在育種家軟件中提供BLUP育種值分析方法,考慮客戶現實需要,博思公司在育種家軟件中新增加了GBLUP育種值計算分析功能。具備全基因組選擇(GS)試驗條件的用戶,可以進行兩種BLUP育種值計算分析,綜合比較分析結果,為育種選擇提供更準確的參考信息。GBLUP是全基因組選擇(GS)中計算材料育種值的一種算法。GBLUP采用分子標記(SNP)信息建立試驗材料間的親緣關系G矩陣,相比依托育種系譜建立的加性遺傳相關矩陣A,理論上更能準確的反應材料間的基因相似程度。GBLUP是傳統BLUP育種值分析方法在分子育種領域的延伸。
 

做育種的同時還承擔國家區域試驗任務,怎樣實現便捷管理?
育種聯合體試驗數據采集匯總怎么辦?
本單位+外單位區域布點試驗數據采集、匯總、分析一體化解決方案

     育種單位承擔國家區域試驗任務,或者聯合體育種試驗,提供品種測試服務的單位試驗數據的采集、上報、管理、分析,生成最終報告,內容雜,環節多,牽扯面廣,令不少用戶頭疼,博思公司新推出解決方案,感興趣的朋友,請跟博思公司了解咨詢。
 

一年多點區域試驗免費在線缺區檢驗
博思公司開發的免費在線檢驗程序。適用于一年多點試驗,根據缺區發生位置,在線檢驗試驗數據是否可以進行方差分析。

品種穩定性分析新增相對平均偏差RSD支持

     相對平均偏差(RSD,Relative Standard Deviation)可以度量穩定性試驗中材料間的數據離散程度,比方差、Shukla方差度量分辨效果更好。為方便用戶使用及比較,穩定性分析同時增加Shukla模型穩定性方法支持。
 1、相對平均偏差RSD應用于一個試驗中品種間穩定性的比較;
 2、穩定性分析模型(Y=μ+年度效應+地點效應+積溫效應+σ),應用于品種適宜推廣地區的定位分析。
農博士育種家軟件為育種后期,材料穩定性評價、品種適合推廣區域定位提供專業統計分析支持。
查看相關文檔:
相對平均偏差在品種穩定性分析中的作用.pdf

Eberhart-Russell模型、Shukla模型、相對平均偏差穩定性分析比較.pdf
   免費在線算RSD

育種專用條碼設計及打印支持

     育種軟件提供育種專用條碼、普通條碼的設計及打印功能。

多作物育種支持

     一套軟件可以管理多種作物同時育種。每種作物的育種性狀可以自定義。采集器配套軟件同步支持多作物,支持多任務同時采集。

新增品種穩定性分析功能

     采用博思公司自主研制的品種穩定性分析理論和方法,將傳統分析方法中基因X環境互作效應用更合理的積溫及其它因素細化替代,能夠更科學合理地反應品種的生產表現。參見《論品種穩定性分析.pdf》

種質庫??櫓卮笊?/font>

     根據客戶反饋意見,種質庫??榻辛酥卮笊?,更好地實現了育種數據??橛脛種士餑?櫚氖萁渙鞴蠶?,支持種質檢索。2016.1

移動育種數據采集系統(安卓Android)

     應廣大用戶要求,博思公司正式推出基于Android(安卓)系統的育種移動數據采集系統,有需要的用戶可以聯系。2015.10

新增分子育種MAS/GS數據分析支持

     提供完整的分子育種與實際育種選擇工作的結合,從分子育種試驗群體效應計算,到依據分子標記效應預測材料表型值,進行育種選擇。

新增α-Lattice(α-格子設計)試驗設計及數據分析支持

     α-格子試驗設計,是當前國外育種企業采用的一種不完全區組試驗設計,主要應用于育種過程中早、中期產量試驗階段的品種篩選。其采用的不完全區組的試驗設計方式,提升了試驗效率,降低了育種試驗成本。與隨機區組試驗設計相比,在參試材料很多的情況下,隨機區組的小區面積急劇擴大,地塊地力差異,對試驗本身產生了破壞性影響,或者可以表述為,試驗設計的局部控制失靈。在不擴大試驗地塊面積的情況下,盡量多安排試驗材料,這就是不完全區組試驗設計的優越性。

NBSBreeding API Ver1.0

   農博士育種家軟件二次開發應用程序接口正式發布,Ver1.0包括41個接口函數,功能涵蓋了,育種年度、性狀、材料、權限、系譜、雜交、統計、圖像等多個???,對正式版用戶免費提供。網站僅提供API手冊下載。NBSBreeding API Ver1.0手冊》下載

植物BLUP育種值估計預測

    育種家軟件基于博思公司研制的BLUP植物育種值模型,成功實現了支持多性狀育種值預測的軟件功能,使用軟件,在選育自交系、常規育種以及配置雜交組合的關鍵環節可以準確把握材料的育種值,準確把握育種方向,將實質性改變植物育種現狀。詳情參閱《博思育種2014》

育種產量相關性狀結構指數

    博思公司根據我國育種家工作需要,自行研制的育種應用指數,該指數實現了育種性狀的綜合數值化目標,指數的高低可以用于度量育種材料的產量潛力,是通過性狀數值化描述育種材料產量潛力的新工具。 育種家軟件自2013.11.04日新版本起將提供該指數計算功能。

在線免費使用

玉米   小麥   水稻
指數詳細介紹(pdf)


軟件購買后終身可以使用,無時間限制,數據存儲在用戶自己的內部服務器上
 



 

主要功能特點:
  • 育種數據采集---管理---分析,一體化的大型育種軟件系統。
  • 集成移動設備,條碼技術,提升數據采集效率,降低數據錯誤,方便育種工作。
  • 將數量遺傳學、生物統計、遺傳學研究成果,與育種數據分析相結合,在用戶傳統經驗育種基礎上,輕松導入及應用先進科學的育種分析方法。定性定量相結合,服務育種工作。
  • 育種數據管理分析,育種試驗設計,育種試驗分析,育種數據采集,統計分析,圖像識別,多種功能集一身。
  • 可自定義育種考察性狀,目前已成功應用于玉米、小麥、水稻、谷子、高粱、番茄、西(甜)瓜、辣椒、油菜、甘蔗、花卉等30多種植物育種領域。
  • 通過質量性狀分級轉換,將分級質量性狀等同數量性狀,一并參與數值計算,極大提升了育種數據利用價值。
  • 調查文本數據與拍攝照片集成管理,看調查數據同時可看所拍攝照片,支持數碼相機同步工作。
  • 照片導入,照片瀏覽管理維護,圖像識別,植株特征識別提取,葉夾角、長寬比、高度、面積、周長、考種計數等功能。株型育種支持。采用sqlserver系列數據庫,支持海量數據存儲。
    籽粒特征提取動畫演示
  • 支持自交系選育管理,系譜動態生成。
  • 支持雜交材料管理,支持系譜管理。
  • 動態試驗設計,對比法、間比法、完全隨機、隨機區組、條區、裂區、拉丁方,常用方差分析,配合力分析,一年多點,多年多點,遺傳模型檢驗等育種分析方法。除此之外,并在數據管理環節內部直接集成諸多統計分析功能,使統計分析應用直接結合數據瀏覽,統計知識的育種指導應用簡單直接,目前集成的統計功能主要有:
    A、質量性狀次數分布(分布圖)
    B、常用統計量自動計算(方差,標準差,變異系數,平均數等)
    C、質量性狀分級顯示
    D、品種評價 / 選擇淘汰 / 關聯度
    E、雜交組合試配(電腦上搞雜交,雜交組合預測)
    F、BLUP
    G、配合力分析
     
  • 雜交組合鑒定管理,方便查看參配材料在組合中表現,看一份材料在所有參配組合的平均表現。
  • 雜交組合預測功能,根據已有雜交組合數據,科學計算預測新組合生產表現,“在電腦上搞組合雜交”,優化育種計劃,提高育種效率。
  • 支持Internet環境下使用,異地遠程數據實時匯總,特別適合在外地有育種點,在海南有加代基地,有合作單位承擔試驗報數據使用。
  • 嚴密的人員權限管理,課題組或者育種組有權限制約實現數據共享,組長可授權查看組員數據,組員僅能查看自己的數據??繕柚娩廊ㄏ?,僅能瀏覽數據,不能更改數據。
  • 育種服務器上的育種家移動采集??榭捎胍貧杉璞肝薹於越?,工作人員田間采集數據可直接存儲到育種服務器,只要有Internet上網連接的地方,都可隨時提交采集數據(比如海南島試驗田里采集設備GPRS上網)
  • 采集數據任務化,育種負責人在育種家軟件中定義采集任務,工作人員通過采集設備接收任務,采集完畢,上報數據。
  • 移動育種數據采集+條碼掃描,是當今國際育種最先進工作模式,極大提高育種數據采集效率,高效、準確、可減輕育種工作人員的繁重工作,節省寶貴時間。
  • 育種家軟件注重育種數據保密性,無論是人員權限還是育種數據采集環節,這種保密性可傳遞到貴單位的整個育種技術體系。
  • 目前,部分國家級、省級農科院所、農業高校和一批知名種業企業已成為育種家軟件忠實用戶。

 

“育種數據管理第一重要”


    “民以食為天,農以種為先”,育種工作的重要性是不言而喻的, 大家都十分清楚。種子企業每年有大量的人員、資金投入到育種科研工作中去, 就為了能育出好品種,大品種。在追求品種的過程中,育種數據信息是最重要的。很多種子公司,包括大型種業企業,在育種數據的管理、匯總、分析、利用上有明顯的不足和落后,育種信息化是很多大型種業企業急需解決的課題。沒有先進的育種數據管理系統,就實現不了現代商業育種。
   沒有數據積累的育種,是沒有前途的育種。
   國際同行早就在使用計算機進行育種科研工作了,這是當前育種一線前沿傳遞給我們的信息,典型的例子,大家都知道先鋒、先正達在用電腦搞育種,我們的電腦用的是Excel進行一些數據管理和處理工作,但顯然,國際同行使用的是專門的育種軟件,Excel僅是一個office辦公電子表格處理軟件,我們的育種工作落后了 。

   手工記錄,方式落后,效率低
    中國目前的育種工作,大多停留在田間手工記錄在本子(田間記載本)上的階段,這樣就需要,二次數據整理和錄入工作,易出錯,數據整理工作量大,數據采集滯后。 甚至出現,歷史育種數據成為垃圾數據的糟糕局面。
   育種工作保密性急需加強
    手工采集方式,決定了額外的技術工人培訓指導,育種工作幾無保密性可言,技術工人管理、使用存在一系列衍生問題。制約育種工作的順利開展。
   育種工作缺乏有力手段實現數據及時匯總
    手工采集的方式,很難保證及時的數據匯總工作,這樣就很難保證育種工作 進度的完成,從全局考慮,增大了育種工作管理的難度。數據報不上來,數據分析利用,制訂下一步育種計劃都要受影響。
   育種工作急需加強數據分析利用工作
    數據的采集是為了數據的分析和利用,很多人談到國內育種工作的水平時會談及“經驗”二字,這讓我們多少有些難堪,個人搞育種憑經驗,我們商業化育種也靠經驗,那就是一件大事了。有的老師會將用Excel進行育種數據管理當做實現了育種信息化,以為用Excel分類匯總,查找材料,就是利用電腦進行育種數據分析了,甚至我們就快趕上先鋒、先正達的育種技術水平了,這真是很膚淺。
    我們拍攝了那么多的材料照片,利用上卻沒有好的辦法,比如:我們看一個材料在多個年代中的田間性狀表現的圖片,無法實現。因為Excel沒有提供這樣的功能。這需要專業的育種數據管理軟件來實現。再比如:需要從歷年材料中篩選出符合某些條件的材料,我們也沒有辦法實現。因為我們的數據是分放在不同Excel表單文件中的。北京中農博思科技發展有限公司提出了一個重要的育種理念:“育種數據管理第一重要”,只有開展了科學扎實的育種數據管理工作才能進行更方便和更高水平的數據分析利用工作,在推廣農博士育種家的同時,我們也在 宣傳這個理念。

    育種工作需要配備高效信息采集設備
    先正達的育種人員田間采集數據使用的是一種移動采集設備,不少國內的育種老師知道了這一情況。農博士育種家的移動采集終端基于Windows Mobile平臺自主開發實現,與農博士育種家軟件無縫鏈接,實現了田間一次數據采集,全部育種數據集中匯總的應用水平。極大提升了育種工作的效率,減輕了育種工作量。
 

 

農博士育種軟硬件系統集成服務(BSI)

在線軟件教程

 

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《育種實用統計學》PDF

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